Ministarstvo poljoprivrede, ribarstva i ruralnog razvoja je nositelj priprema za pregovore u tri od ukupno 35 poglavlja EU zakonodavstva: Poglavlje 11. Poljoprivreda i ruralni razvitak, Poglavlje 12. Sigurnost hrane, veterinarstvo i fitosanitarni nadzor te Poglavlje 13. Ribarstvo.
Hrvatska je prve ugovore o slobodnoj trgovini počela primjenjivati u drugoj polovici 1990-tih godina (s Makedonijom od sredine 1997., a sa Slovenijom od 1998. godine). Međutim, veća liberalizacija poljoprivredne trgovine nastupila je nakon ulaska RH u Svjetsku trgovinsku organizaciju u studenom 2000. godine.
